MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus cereus E33L plasmid pE33L9

Total Repeats: 261

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007107	TA	3	6	3	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007107	AAT	2	6	20	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007107	TAT	2	6	31	36	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007107	A	7	7	61	67	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007107	TTG	2	6	106	111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007107	TCAC	2	8	119	126	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007107	A	6	6	172	177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007107	TAG	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007107	GA	3	6	217	222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007107	ATT	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007107	AAG	2	6	244	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007107	CTT	2	6	274	279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007107	T	6	6	278	283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007107	TA	3	6	348	353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007107	TATT	3	12	371	382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007107	TA	3	6	390	395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007107	TTA	2	6	411	416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007107	T	8	8	424	431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007107	TAT	3	9	437	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007107	TC	3	6	476	481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007107	ACT	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007107	AT	3	6	491	496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007107	T	6	6	502	507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007107	ACTCTC	2	12	528	539	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007107	AAGGAA	2	12	564	575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007107	T	7	7	580	586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007107	AATA	2	8	592	599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007107	AGG	2	6	666	671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007107	A	7	7	688	694	100 %	0 %	0 %	0 %	67078391
30	NC_007107	CATTTT	2	12	734	745	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	67078391
31	NC_007107	TAAA	2	8	773	780	75 %	25 %	0 %	0 %	67078391
32	NC_007107	CTA	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078391
33	NC_007107	AAT	2	6	823	828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078391
34	NC_007107	TGG	3	9	894	902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67078391
35	NC_007107	AGT	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078391
36	NC_007107	AAG	2	6	960	965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078391
37	NC_007107	GGA	2	6	994	999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67078391
38	NC_007107	TTG	2	6	1025	1030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67078391
39	NC_007107	AATC	2	8	1045	1052	50 %	25 %	0 %	25 %	67078391
40	NC_007107	A	6	6	1067	1072	100 %	0 %	0 %	0 %	67078391
41	NC_007107	TA	3	6	1076	1081	50 %	50 %	0 %	0 %	67078391
42	NC_007107	ACTTT	2	10	1111	1120	20 %	60 %	0 %	20 %	67078391
43	NC_007107	TAT	2	6	1189	1194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078391
44	NC_007107	TAAAA	2	10	1195	1204	80 %	20 %	0 %	0 %	67078391
45	NC_007107	A	6	6	1201	1206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007107	T	6	6	1233	1238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007107	ATT	2	6	1272	1277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007107	TAAT	2	8	1327	1334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007107	AAAC	2	8	1352	1359	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007107	AT	3	6	1407	1412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007107	AT	3	6	1445	1450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007107	AT	3	6	1454	1459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007107	GTTA	2	8	1460	1467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007107	AG	3	6	1469	1474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007107	AT	3	6	1486	1491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007107	TTTA	2	8	1517	1524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007107	AAG	2	6	1529	1534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007107	ATTTT	2	10	1541	1550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007107	A	6	6	1559	1564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007107	GAA	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007107	T	6	6	1588	1593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007107	AT	4	8	1686	1693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007107	GAA	2	6	1729	1734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007107	GCA	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67078392
65	NC_007107	TCA	2	6	1834	1839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078392
66	NC_007107	CAT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007107	TCG	2	6	2095	2100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007107	GTG	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007107	AATC	2	8	2172	2179	50 %	25 %	0 %	25 %	67078393
70	NC_007107	AAG	2	6	2311	2316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078393
71	NC_007107	TGA	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078393
72	NC_007107	CTA	2	6	2369	2374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078393
73	NC_007107	GAC	2	6	2445	2450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67078393
74	NC_007107	A	6	6	2469	2474	100 %	0 %	0 %	0 %	67078393
75	NC_007107	ATG	3	9	2548	2556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078393
76	NC_007107	AGT	2	6	2601	2606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078393
77	NC_007107	GCA	2	6	2645	2650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67078393
78	NC_007107	GA	3	6	2693	2698	50 %	0 %	50 %	0 %	67078393
79	NC_007107	ATT	2	6	2823	2828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078393
80	NC_007107	AAGAAA	2	12	2842	2853	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	67078393
81	NC_007107	GATT	2	8	2867	2874	25 %	50 %	25 %	0 %	67078393
82	NC_007107	A	6	6	2882	2887	100 %	0 %	0 %	0 %	67078393
83	NC_007107	GAATTA	2	12	2907	2918	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67078393
84	NC_007107	TGT	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67078393
85	NC_007107	AGT	2	6	2969	2974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078393
86	NC_007107	ACA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67078393
87	NC_007107	AG	3	6	2987	2992	50 %	0 %	50 %	0 %	67078393
88	NC_007107	TGAAAA	2	12	2993	3004	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67078393
89	NC_007107	A	6	6	3040	3045	100 %	0 %	0 %	0 %	67078393
90	NC_007107	AGT	3	9	3131	3139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078393
91	NC_007107	GAA	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078393
92	NC_007107	AACAA	2	10	3230	3239	80 %	0 %	0 %	20 %	67078393
93	NC_007107	AGAC	2	8	3286	3293	50 %	0 %	25 %	25 %	67078393
94	NC_007107	TGCA	2	8	3322	3329	25 %	25 %	25 %	25 %	67078393
95	NC_007107	GAAA	2	8	3341	3348	75 %	0 %	25 %	0 %	67078393
96	NC_007107	A	6	6	3367	3372	100 %	0 %	0 %	0 %	67078393
97	NC_007107	AAG	2	6	3385	3390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078393
98	NC_007107	TGTA	2	8	3463	3470	25 %	50 %	25 %	0 %	67078393
99	NC_007107	A	6	6	3477	3482	100 %	0 %	0 %	0 %	67078393
100	NC_007107	ATT	2	6	3516	3521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078393
101	NC_007107	A	6	6	3573	3578	100 %	0 %	0 %	0 %	67078393
102	NC_007107	TGGAT	2	10	3596	3605	20 %	40 %	40 %	0 %	67078393
103	NC_007107	A	7	7	3673	3679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007107	A	6	6	3785	3790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007107	TTG	2	6	3800	3805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007107	AGG	2	6	3819	3824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007107	A	8	8	3843	3850	100 %	0 %	0 %	0 %	67078394
108	NC_007107	TTA	2	6	3851	3856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078394
109	NC_007107	A	7	7	3872	3878	100 %	0 %	0 %	0 %	67078394
110	NC_007107	AAAG	2	8	3883	3890	75 %	0 %	25 %	0 %	67078394
111	NC_007107	GTG	2	6	3932	3937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67078394
112	NC_007107	GAA	3	9	3946	3954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078394
113	NC_007107	TGC	2	6	3965	3970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	67078394
114	NC_007107	TGG	2	6	3990	3995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67078394
115	NC_007107	AGA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078394
116	NC_007107	A	6	6	4021	4026	100 %	0 %	0 %	0 %	67078394
117	NC_007107	ATT	2	6	4073	4078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078394
118	NC_007107	TTG	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	67078394
119	NC_007107	A	7	7	4169	4175	100 %	0 %	0 %	0 %	67078394
120	NC_007107	ATG	2	6	4181	4186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078394
121	NC_007107	ATG	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078394
122	NC_007107	TAA	2	6	4313	4318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078394
123	NC_007107	AT	3	6	4367	4372	50 %	50 %	0 %	0 %	67078394
124	NC_007107	GAT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078394
125	NC_007107	CAA	2	6	4411	4416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67078394
126	NC_007107	T	6	6	4418	4423	0 %	100 %	0 %	0 %	67078394
127	NC_007107	TAA	2	6	4455	4460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078394
128	NC_007107	A	6	6	4462	4467	100 %	0 %	0 %	0 %	67078394
129	NC_007107	ATTT	3	12	4480	4491	25 %	75 %	0 %	0 %	67078394
130	NC_007107	T	7	7	4518	4524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007107	T	6	6	4540	4545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007107	A	8	8	4553	4560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007107	T	8	8	4577	4584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007107	ATT	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007107	CTTT	2	8	4621	4628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007107	TA	4	8	4648	4655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007107	GTA	2	6	4681	4686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007107	ACG	2	6	4698	4703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007107	TCA	2	6	4721	4726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007107	A	6	6	4728	4733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007107	TCTTT	2	10	4767	4776	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007107	T	6	6	4774	4779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007107	ATG	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007107	T	6	6	4798	4803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007107	CGG	2	6	4804	4809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007107	CCG	2	6	4882	4887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_007107	CAGC	2	8	4971	4978	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007107	G	6	6	4996	5001	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.